需要注意的是，“绿色清单”如果使用不好，可能会造成另外一些问题。列入清单的产品是否真实、全面地反映实际情况，列举的过程是否科学、公正及合理合法，如果不能做到，就可能产生不公正和不客观的问题，从而有可能导致事实上的歧视行为，还可能在清单列制过程中产生寻租便利和腐败行为，从而使“绿色清单”有可能变成“歧视清单”和“腐败清单”，影响政府采购的公正性和实际效果。因此，一般情况下，“绿色清单”主要的功能应该是指导性的。因为政府的采购可能要达成多种目标，而节能环保只能是多种目标中的一部分。